Faktai iš mokyklos istorijos:

• Panevėžio 13-oji vidurinė mokykla pradėta statyti 1977 metų rugsėjo mėnesį. Mokykla atvėrė duris 1978 metų rugsėjo 1 dieną.

•          Pirmuoju mokyklos direktoriumi buvo Juozas Vaidilas. Jis dirbo iki 1987 metų. Nuo 1987 metų iki dabar mokyklai vadovauja Alfredas Paberžis.

•      Direktoriaus pavaduotojais dirbo Irena Pranckevičienė (1978–2005 metais), Antanas Doniela, Danutė Zopelytė, Regina Giedrienė, Teresė Guligauskienė, Loreta Švarlienė, Daiva Pakatilevičienė.

•             Dabar direktoriaus pavaduotojomis dirba Vilija Aleliūnienė (nuo 1994 m.) ir Virginija Jeleniauskienė (nuo 1997 m.).

•       Panevėžio miesto tarybos 1995 metų spalio 19 d. sprendimu Nr. 10-17  mokyklai suteiktas Mykolo Karkos, žymaus miesto pedagogo, muzikologo, miesto operetės įkūrėjo, dainų švenčių organizatoriaus, vardas. Nuo to laiko kiekvieną lapkričio 12 d., Mykolo Karkos gimimo dieną, mokykla švenčia savo Mokyklos vardo dieną.

•        2000 m. lapkričio 12 d. pavaduotojos Irenos Pranckevičienės ir mokytojos Vitalijos Masilionytės iniciatyva įkurtas mokyklos istorijos muziejus.

•            2008 m. lapkričio 12 d. mokykla minėjo veiklos 30-metį. Per 30 metų mokyklą baigė 13 abiturientų aukso medaliu, 31 – sidabro medaliu, 31 – su pagyrimu.

•            2008–2009 m. m. mokykla išleido paskutiniąją – 29-ąją – abiturientų laidą.

•            Nuo 2009 m. rugsėjo 1 d. mokykla reorganizuota į pagrindinę mokyklą.

•            2012 m. lapkričio 12 d. švenčiamas Mykolo Karkos 120 gimimo metinių jubiliejus.

•            2013 m. rugsėjo 1 d. prie Mykolo Karkos pagrindinės mokyklos prijungta „Verdenės“ pagrindinė mokykla.

•        2018 m. lapkričio mėn. mokykla minėjo veiklos 40-metį.